Indikation
Misstanke om invasiv bakterieorsakad infektion. Särskilt lämpligt vid misstanke om svårodlade eller icke-odlingsbara bakterier.
Provmaterial
Prov från normalt steril lokal t. ex. glaskroppsaspirat, likvor, ledvätska, vävnadsbiopsier eller blod.
Blod analyseras inte rutinmässigt med PCR teknik, eftersom denna ej medger antibiotikaresistens-bestämning. Vid kvarstående sepsismisstanke trots negativa blododlingar kan PCR ändå vara aktuellt.
Analysprincip
PCR (polymerase chain reaction) och sekvensering av den bakteriella genen för 16S rRNA.
Provtagningsmaterial
Sterilt rör av glas eller polypropylen utan tillsats.
Blod transporteras i ett citrat- eller EDTA- rör. Vid misstanke om så kallad neo-infektion (infektion med "Neo" - Candidatus Neoerlichia mikurensis) önskas två EDTA-rör och ett citrat-rör.
Provtransport
I väntan på transport bör provet förvaras i kyl. Vid längre transport än 24 timmar rekommenderas kyltransport.
Blod transporteras i rumstemperatur.
Ange att bakteriespecifik PCR önskas.
Bedömning och svarsrutiner
Förekomst eller inte av bakteriellt DNA. Sekvensering för artbestämning utförs vid förekomst av bakteriellt DNA.
Speciella frågeställningar
Före insändandet av vävnadsbiopsier tag kontakt med DNA-lab,
tel 031-342 46 98.